Hlavní typy: Patří sem biguanidy, alkoholy, fenoly, organické aminy, pyridiny, isothiazolinony a další.
Charakteristika: Vykazují rychlé baktericidní účinky; mají však relativně špatnou tepelnou stabilitu a trvanlivost a mohou mít určité nepříznivé vedlejší účinky. Snadno se vážou na aniontová místa na povrchu bakteriálních a plísňových buněčných membrán nebo reagují se sulfhydrylovými skupinami, čímž narušují syntézu proteinů a systém buněčné membrány, což účinně inhibuje proliferaci bakterií a plísní. Přesto jsou náchylné k rozkladu působením ultrafialového světla, což má za následek krátkou životnost; dále některá organická antimikrobiální činidla mohou mít toxické vedlejší účinky.
Aplikace: V současnosti jsou nejrozšířenějšími a nejpoužívanějšími organickými povrchově -aktivními antimikrobiálními činidly dusíkové-kationtové sloučeniny-, jako jsou kvartérní amoniové soli-, které se široce používají v antimikrobiálních nátěrech.
